Genómica y Proteómica

Prerrequisito: Introducción a la Bioinformática, Biología Celular y Molecular I

Motivación y Descripción del Curso

La teoría de sistemas postulada a inicios de los 50s generó una nueva perspectiva organizacional pertinente, entre otros, a los sistemas biológicos. Esta perspectiva permite ver a los sistemas como algo más que la suma de sus partes individuales, ya que las partes del sistema, de manera regulada y precisa, se sincronizan para un fin específico. Desde esta perspectiva holística el funcionamiento celular solo puede ser entendido en un marco de integralidad, al cual se ha podido acceder cuando se analizan sistemáticamente los procesos celulares por medio de las tecnologías ómicas (genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica e interactómica).

Objetivos

El presente curso de genómica y proteómica busca que el estudiante doctoral comprenda los procesos celulares desde una perspectiva integrativa mediante el entendimiento global de las características estructurales del genoma, su relación con los procesos de regulación orquestada de la expresión genética y los eventos de interacción específica entre proteínas que determinan una respuesta fenotípica particular. El alumno aprenderá a identificar, entender, manipular y aplicar herramientas específicas tanto genómicas como proteómicas que le permitirán aproximarse a un problema de investigación particular desde una perspectiva holística.

Contenido

Doctorado en Ingeniería: Genomics and Proteomics

WEEKCONTENTPROF.
Week 1Genome sequencing (Techniques)FTT
Week 2Genome sequencing (Method of analysis)FTT
Week 3Genome structure (Genomic elements organization and function)FTT
Week 4Genome structure (Genomic elements organization and function)FTT
Week 5Transcriptome (Techniques and Methods of analysis )FTT
Week 6Noncoding RNAFTT
Week 7DNA variants and phenotypic correlationFTT
Week 8 ExamDNA variants and phenotypic correlationFTT
Week 9Protein Structure and study by wet techniquesMQ
Week 10Protein Structure and study by wet techniquesMQ
Week 11Protein Structure and study by in-silico techniquesMQ
Week 12Protein-Protein interactions (Techniques and Method of analysis)MQ
Week 13Protein-Protein interactions (Techniques and Method of analysis)MQ
Week 14Interactomics and interactional networks among proteinsMQ
Week 15Interactomics and interactional networks among proteinsMQ
Week 16 ExamConcepts of Metabolomics and other related omics.MQ

Metodología

Dado que el curso sería un curso de formación, la enseñanza de los conceptos fundamentales se basará en clases magistrales en donde el profesor mediante diferentes modalidades de exposición y previa preparación de la clase por parte del estudiante, explicará los temas correspondientes y buscará resolver las posibles dudas que surjan. Sin embargo, dado que el curso haría parte de un proceso de formación doctoral, el curso tendrá un fuerte componente de investigación basado en talleres prácticos, rutinas computacionales y en el análisis y discusión de artículos y literatura científica en el que el producto final de dicha investigación será un trabajo escrito estructurado a manera de artículo científico de revisión relacionado con algún tema pertinente y actual de biología celular y molecular. Los ejercicios de laboratorio también tendrán un peso importante para el desarrollo de habilidades prácticas, que les permitan a los estudiantes llevar el conocimiento teórico adquirido en clase a la práctica para la aprehensión de conceptos teóricos básicos, y para la solución de problemas biológicos celulares y moleculares específicos.

Sistema de Evaluación

30%Examen Parcial
30%Examen Final
30%Prácticas de Investigación
10%Laboratorios, Seminario, Otros

Bibliografía

  • Bioinformatics: An Introduction Computational Biology 21. Jeremy Ramsden. Springer-Verlag London (2015).
  • Discovering Genomics, Proteomics & Bioinformatics. A, Campbell & L, Heyer. Second edition. Benjamin Cummings. New York (2006).
  • Introduction to Genomics. Arthur M. Lesk. Second edition. Oxford University Press New York (2012).
  • Systems Biology a Textbook. Edda Klipp et al. Wiley-Blackwell. London (2009).
 
materias/genomica_y_proteomica.txt · Última modificación: 2015/10/30 11:34 por laura.triana
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